Como no especificas bien que es lo que quieres (craneo Tormenta electrica o mision La tormenta) te voy a dar la info de ambas:
En la mision "La tormenta" al salir del primer almacen veras un campo abierto con un "wraith anti-aereo" lo que deves de hacer es tomar un ghost e ir a toda prisa hacia el graith, te bajas y te subes detras del graith para meterme una granada, despues te acercas al edificio cilindrico que esta cerca "silo" y usa un salto-granada para subirte, la calavera estara en el centro.
Si no alcanzas reinicia el checkpoint y usa un warthog para subirte en el y luego saltar al "silo".
Si destruyes la otra wraith (normal) el craneo desaparecera.

Craneo Tormenta electrica: en el capitulo "si quieres que algo se haga bien" cuando despegas en el Hornet dirigete a toda velocidad hacia la plataforma de donde despegan un par de phantoms verdes (camunflados) aterriza y explora la zona, ahi encontraras una terminal y el craneo Tormenta electrica.

Espero que te haya servido.